福建（泉州）先進制造技術研究院為事業單位法人單位，實行理事會領導下的院長負責制。蔡鶴皋院士為名譽理事長，院長由理事會選聘任用，為研究院業務和科研工作的第一負責人。

自成立以來，研究院完成了組織架構建設，設立了技術中心、自動化裝備部、機器人技術部、智能技術部、中試基地、項目管理部、行政部、財務部等職能部門，聯合當地企業進行產學研合作，推進科研成果轉化和市場推廣應用。此外，研究院還先后在南安市、石獅市、永春縣等地設立了工作站，并派專人專崗進行技術對接，專門對接當地與研究院的產學研合作事宜。

研究院秉承“創新科技 智造未來”的研發理念，針對機器人產業發展技術創新要求，充分發揮福建泉州市政策、資金、環境優勢，承接哈工大在機器人及自動化方面的人才和技術優勢，打造集技術創新平臺、人才培育平臺、產業投資與科技孵化平臺、公共技術服務平臺等功能為一體的全方位服務平臺。